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Los principales intereses de investigación de Nektarios se centran en la Historia Macroeconómica Cuantitativa y la Macrofinanza Empírica.
Nektarios cuenta con más de 30 publicaciones en revistas académicas internacionales reconocidas (como Journal of Economic History, Economic History Review, Journal of International Money and Finance, Journal of Banking and Finance, Journal of Empirical Finance, Journal of Economic Behavior and Organization, Annals of Operations Research, entre otras), así como con un gran número de participaciones en congresos académicos internacionales. También ha sido invitado a impartir seminarios en universidades de prestigio, como la University of Nottingham, la University of York, Sciences Po Toulouse, la University of California Davis, la Athens University of Economics and Business, la University of Melbourne, la Monash University, la University of Sydney, la Universitat Pompeu Fabra, la Waseda University (Tokio), la University of Manchester y la Stockholm School of Economics, así como en bancos centrales, incluidos los de Francia, España, Grecia, Chipre, el Reserve Bank of New Zealand y el Banco Central de Estonia.
En 2020, Nektarios y sus coautores recibieron el Premio Hamilton de la Asociación Española de Historia Económica al mejor artículo publicado en revistas académicas internacionales. El premio fue otorgado por el artículo: Nogues-Marco P., A. Herranz-Loncán y N. Aslanidis (2019), The Making of a National Currency. Spatial Transaction Costs and Money Market Integration in Spain (1825-1874), Journal of Economic History 79, 1094-1128.
Además, Nektarios trabajó como investigador en el Centro de Investigación Ente Luigi Einaudi del Banco de Italia (2003), así como en el Banco Central de Estonia (2005). En los últimos cuatro años, Nektarios ha recibido financiación en dos ocasiones para su investigación en historia económica por parte del Banco de España.
Nektarios es miembro del Consejo de Investigación de Estonia / Comité de Expertos en Ciencias Sociales y miembro del Centro Nacional de Ciencia de Polonia / Panel de Expertos del programa PRELUDIUM.